Richard Owen föddes den 20 juli 1804 i Lancaster i norra England som ett av sex barn till affärsmannen Richard Owen och dennes maka Catherine Parrin. Fadern dog när Richard var fem år, och kort därefter skickades pojken till en internatskola. Där visade han inga tecken på någon särskild begåvning och beskrevs av en av sina lärare som "lat och näsvis".
Men allt ändrades när han efter skolan, vid 16 års ålder, började som lärling hos en kirurg. Han fick vara med när denne utförde obduktioner på avlidna fångar från det lokala fängelset, och det var då hans närmast fanatiska intresse för anatomi vaknade.
Vid 20 års ålder började Richard Owen läsa medicin och anatomi vid universitet i Edinburgh, studier som han sedan slutförde i blixtfart i London, varpå han antogs som medlem av Royal College of Surgeons.
Men levande patienter var inget som intresserade Richard Owen nämnvärt. I stället började han 1827 som konservator vid Hunterian Museum, där han genast satte igång med det omfattande arbetet att dokumentera och katalogisera de stora samlingar av prover från djur och människa som den berömde kirurgen John Hunter lämnat efter sig.